益智仁果实呈纺锤形或椭圆形，长1.5-2cm，直径1-1.2cm。外皮红棕色至灰棕色，有纵向断续状的隆起线13-18条。皮薄而稍韧，与种子紧贴。种子集结成团，分3瓣，中有薄膜相隔，每瓣有种子6-11粒。种子呈不规则扁圆形，略有钝棱，直径约3mm，厚约1.5mm，表面灰褐色或灰黄色；种脐位于腹面的中央，微凹陷，自种脐至背面的合点处，有一条沟状种脊；破开后里面为白色，粉性。臭特殊，味辛微苦。